{"help":"https://catalogue.cioos.ca/api/3/action/help_show?name=package_show","success":true,"result":{"id":"e4038a43-060b-474e-b6f2-ea68d0081053","ecv":["inorganic_carbon"],"eov":["inorganicCarbon","other"],"url":null,"name":"ca-cioos_78818ed7-ec26-4004-afa1-137741ddda1e","tags":[],"type":"dataset","notes":"Ce paquet de données fait partie du projet collaboratif Marna Wet Lab de l'Institut Hakai et du Martone Lab (Université de la Colombie-Britannique, UBC) qui étudie les effets environnementaux sur les algues coralliennes. Le programme de recherche expérimentale Marna Wet Lab de l'Institut Hakai utilise des expériences de laboratoire pour évaluer les réponses des organismes marins à des conditions environnementales océaniques simulées actuelles et futures. L'objectif principal de la recherche expérimentale du Hakai Wet Lab est d'étudier les mécanismes de vulnérabilité et de résilience de diverses espèces et communautés marines dans des conditions environnementales futures statiques ou dynamiques, et de comprendre comment les organismes réagissent phénotypiquement, physiologiquement et/ou génomiquement au stress thermique et à l'acidification.\n\nLes algues corallines constituent un groupe diversifié d'algues rouges calcifiantes qui peuplent un large éventail d'environnements marins dans le monde entier où elles fournissent un soutien structurel aux récifs, créent un habitat et des ressources alimentaires pour les invertébrés et soutiennent la biodiversité en favorisant le recrutement de larves et de varech. L'une des caractéristiques uniques de ce groupe d'algues rouges est qu'elles déposent du carbonate de calcium dans leurs parois cellulaires végétatives, créant ainsi une structure de thalle rigide essentielle au soutien et à l'habitat. Bien que la calcification soit un processus clé pour la physiologie et l'écologie des algues coralliennes, on en sait peu sur les mécanismes moléculaires, physiologiques et cellulaires qui la soutiennent et sur la manière dont ceux-ci peuvent être affectés par les changements climatiques. Des travaux sur d'autres espèces tropicales d'algues coralliennes ont toutefois suggéré que les algues calcifiantes pourraient être particulièrement sensibles au stress thermique et à l'acidification, bien que les réponses des espèces tempérées soient largement sous-étudiées.\n\nDes travaux sont en cours dans le laboratoire du Dr Patrick Martone pour identifier des gènes de calcification putatifs à l'aide de transcriptomes spécifiques aux tissus (calcifiés ou non calcifiés) (RNASeq) chez l'algue coralline articulée, Calliarthron tuberculosis. L'objectif de ce travail est de comprendre les fondements moléculaires du mécanisme de calcification en mettant en évidence les principaux gènes de calcification et en développant des amorces qPCR spécifiques aux gènes pour étudier l'expression des gènes. Sur la base de ces travaux fondamentaux, nous proposons d'explorer les effets interactifs du pH et de la température sur une population de Calvert de Calliarthron en nous concentrant sur la calcification, l'expression génique, la croissance et les réponses physiologiques au stress par le biais d'une expérience en mésocosme de plusieurs semaines.\n\nCe paquet de données comprend une partie des données de cette expérience concernant la température du mésocosme et la chimie des carbonates et les protocoles associés, le traitement et l'analyse de ces données collectées par l'équipe du Marna Wet Lab. Des données expérimentales supplémentaires sont détenues par nos collaborateurs Emma Jourdain et Patrick Martone (UBC).\n\nCompte tenu des efforts nécessaires pour obtenir ces données et créer des packages de données, nous demandons à tous les utilisateurs de données de respecter les termes de la licence CC-BY, de citer les fournisseurs de données et de suivre les directives d'utilisation équitable : 1) respecter les fournisseurs de données et fournir des commentaires utiles sur la qualité des données, et 2) communiquer et/ou collaborer avec les chercheurs et collaborateurs du Hakai Marna Wet Lab si vous envisagez d'utiliser cet ensemble de données pour des manuscrits ou d'autres formes de reporting.","state":"active","title":"Expérience Calliarthron 2023 - Données environnementales","author":null,"extras":[{"key":"access_constraints","value":""},{"key":"contact-email","value":"kate.rolheiser@hakai.org"},{"key":"encoding","value":"utf8"},{"key":"guid","value":"ca.cioos_78818ed7-ec26-4004-afa1-137741ddda1e"},{"key":"h_job_id","value":"ad51821a-c51c-4914-8e02-04a2de1575d7"},{"key":"h_object_id","value":"2667dde3-02d3-4af8-b0a9-39a9ab0e988c"},{"key":"h_source_id","value":"9704fc28-20f2-4eb1-92d5-b5b47fc23354"},{"key":"h_source_title","value":"CIOOS Pacific"},{"key":"h_source_url","value":"https://catalogue.cioospacific.ca"},{"key":"harvest_object_id","value":"2667dde3-02d3-4af8-b0a9-39a9ab0e988c"},{"key":"harvest_source_id","value":"9704fc28-20f2-4eb1-92d5-b5b47fc23354"},{"key":"harvest_source_organization","value":"{\"id\": \"f6f187f7-19f2-4273-a45a-5d9406204873\", \"name\": \"cioos-pacific\", \"title\": \"SIOOC-Pacifique\", \"type\": \"organization\", \"description\": \"\", \"image_url\": \"\", \"created\": \"2026-07-31T15:58:21.015456\", \"is_organization\": true, \"approval_status\": \"approved\", \"state\": \"active\", \"description_translated\": {\"en\": \"The Canadian Integrated Ocean Observing System (CIOOS) Pacific is the regional hub of the National CIOOS for ocean data aggregation on Canada\\u2019s west coast.\", \"fr\": \"Le Syst\\u00e8me int\\u00e9gr\\u00e9 d\\u2019observation des oc\\u00e9ans canadien (SIOOC) Pacifique est la plaque tournante r\\u00e9gionale du SIOOC national pour l\\u2019agr\\u00e9gation des donn\\u00e9es oc\\u00e9aniques sur la c\\u00f4te ouest du Canada.\"}, \"display_name\": \"CIOOS-Pacific\", \"external_home_url\": \"https://cioospacific.ca\", \"image_display_url\": \"\", \"image_url_translated\": {\"en\": \"https://catalogue.cioos.ca/base/images/logos/cioos-pacific_logo_RA_EN.png\", \"fr\": \"https://catalogue.cioos.ca/base/images/logos/cioos-pacific_logo_RA_FR.png\"}, \"num_followers\": 0, \"title_translated\": {\"en\": \"CIOOS-Pacific\", \"fr\": \"SIOOC-Pacifique\"}, \"organization-uri\": [{\"authority\": \"\", \"code\": \"\", \"code-space\": \"\", \"version\": \"\"}]}"},{"key":"harvest_source_title","value":"CIOOS Pacific"},{"key":"legal-constraints-reference-code","value":"CC-BY-4.0"},{"key":"licence","value":"Please communicate with authors of this dataset if you plan to use it."},{"key":"metadata-date","value":"2025-05-08T21:25:48.428Z"},{"key":"metadata_created_source","value":"2025-11-08T00:18:22.216929"},{"key":"metadata_modified_source","value":"2025-11-08T00:18:22.216935"},{"key":"responsible-party","value":"[{\"name\": \"Hakai Institute\", \"roles\": [\"author\", \"editor\", \"custodian\", \"pointOfContact\", \"coAuthor\"]}, {\"name\": \"University of British Columbia\", \"roles\": [\"custodian\", \"author\", \"pointOfContact\", \"owner\", \"principalInvestigator\", \"distributor\"]}, {\"name\": \"Tula Foundation\", \"roles\": [\"funder\"]}]"},{"key":"spatial_harvester","value":"true"},{"key":"uri","value":"https://catalogue.hakai.org/dataset/ca-cioos_78818ed7-ec26-4004-afa1-137741ddda1e"},{"key":"use-constraints","value":"Please communicate with authors of this dataset if you plan to use it."},{"key":"use-constraints-code","value":"licence"},{"key":"xml_modified_date","value":"2025-05-08 21:30:00"}],"groups":[{"id":"1b19a03b-cb31-4258-92b2-e1e2f74235ca","name":"resorg_hakai-institute","type":"resorg","state":"active","title":"Hakai Institute","created":"2026-07-31T16:03:25.855614","image_url":"","description":"","display_name":"Hakai Institute","num_followers":0,"approval_status":"approved","is_organization":false,"title_translated":{"en":"Hakai Institute","fr":"Hakai Institute"},"image_display_url":"","image_url_translated":{},"description_translated":{}},{"id":"b750c469-81ab-4424-a72b-fe46cdc7e3e9","name":"resorg_university-of-british-columbia","type":"resorg","state":"active","title":"University of British Columbia","created":"2026-07-31T16:10:52.223579","image_url":"","description":"","display_name":"University of British Columbia","num_followers":0,"approval_status":"approved","is_organization":false,"title_translated":{"en":"University of British Columbia","fr":"University of British Columbia"},"image_display_url":"","image_url_translated":{},"description_translated":{}}],"isopen":true,"private":false,"spatial":{"type":"Point","coordinates":[-125.2,50.12]},"citation":{"en":"[{\\\"type\\\": \\\"dataset\\\", \\\"id\\\": \\\"ca.cioos_78818ed7-ec26-4004-afa1-137741ddda1e\\\", \\\"author\\\": [{\\\"given\\\": \\\"Kate\\\", \\\"family\\\": \\\"Rolheiser\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Brenna\\\", \\\"family\\\": \\\"Collicutt\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Emma\\\", \\\"family\\\": \\\"Jourdain\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Jacob M\\\", \\\"family\\\": \\\"Etzkorn\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Shelby\\\", \\\"family\\\": \\\"McCay\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Bradford\\\", \\\"family\\\": \\\"Vinson\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Patrick\\\", \\\"family\\\": \\\"Martone\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Iria\\\", \\\"family\\\": \\\"Gimenez\\\"}], \\\"issued\\\": [{\\\"date-parts\\\": [\\\"2025\\\", \\\"05\\\", \\\"08\\\"]}], \\\"abstract\\\": \\\"This data package is a component of the Hakai Institute\\u2019s Marna Wet Lab and the Martone Lab (University of British Columbia, UBC) collaborative project investigating environmental effects on coralline algae. Hakai Institute's Marna Wet Lab experimental research program uses laboratory experiments to evaluate marine organisms' responses to simulated current and future ocean environmental conditions. The overarching objective of Hakai Wet Lab experimental research is to investigate the mechanisms of vulnerability and resilience of a variety of marine species and communities under static or dynamic future environmental conditions, and understand how organisms are responding phenotypically, physiologically and/or genomically to thermal and acidification stress.\\n\\nCoralline algae are a diverse group of calcifying red algae that populate a wide range of marine environments globally where they provide structural support to reefs, create habitat and food resources for invertebrates and support biodiversity by promoting larval and kelp recruitment. A unique characteristic of this group of red algae is that they deposit calcium carbonate within their vegetative cell walls creating a hard thallus structure that is essential for providing support and habitat. While calcification is a key process for coralline algae physiology and ecology there is little known about the molecular, physiological and cellular mechanisms that support it and how those might be affected by changing climate conditions. Work on other tropical species of coralline algae, however, has suggested that calcifying algae might be particularly sensitive to thermal and acidification stress, though responses of temperate species are vastly understudied.\\n\\nCurrent work in Dr. Patrick Martone's lab is underway to identify putative calcification genes using tissue-specific (calcified vs. uncalcified) transcriptomes (RNAseq) in the articulated coralline alga, Calliarthron tuberculosum. The aim of this work is to understand the molecular underpinnings of the calcification mechanism by highlighting key calcification genes and developing gene-specific qPCR primers to study gene expression. Building on this foundational work, we propose to explore the interactive effects of pH and temperature on a Calvert population of Calliarthron focusing on calcification, gene expression, growth, and physiological stress responses through a multi-week mesocosm experiment.\\n\\nThis data package includes a portion of the data from this experiment relating to mesocosm temperature and carbonate chemistry and associated protocols, processing and analysis of that data collected by the Marna Wet Lab team. Additional experimental data is held by our collaborators Emma Jourdain and Patrick Martone (UBC). All data will be available upon request until the manuscript has been accepted at which time the data will be made publicly available. \\n\\nIn light of the effort required to obtain these data and create data packages, we request all data users that, in addition to following the CC-BY license terms, they give attribution to the data providers and follow fair use guidelines: 1) respect the data providers, and provide helpful feedback on data quality, and 2) communicate and/or collaborate with Hakai Marna Wet Lab researchers and collaborators if you are considering using this dataset for manuscripts or other forms of reporting.\\\", \\\"edition-date\\\": \\\"\\\", \\\"publisher\\\": \\\"Hakai Institute\\\", \\\"title\\\": \\\"Calliarthron 2023 Experiment - Environmental Data\\\", \\\"version\\\": \\\"1.0.0\\\", \\\"DOI\\\": \\\"10.21966/7nwn-bj60\\\", \\\"language\\\": \\\"en\\\", \\\"URL\\\": \\\"https://catalogue.hakai.org/dataset/ca-cioos_78818ed7-ec26-4004-afa1-137741ddda1e?local=en\\\"}]","fr":"[{\\\"type\\\": \\\"dataset\\\", \\\"id\\\": \\\"ca.cioos_78818ed7-ec26-4004-afa1-137741ddda1e\\\", \\\"author\\\": [{\\\"given\\\": \\\"Kate\\\", \\\"family\\\": \\\"Rolheiser\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Brenna\\\", \\\"family\\\": \\\"Collicutt\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Emma\\\", \\\"family\\\": \\\"Jourdain\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Jacob M\\\", \\\"family\\\": \\\"Etzkorn\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Shelby\\\", \\\"family\\\": \\\"McCay\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Bradford\\\", \\\"family\\\": \\\"Vinson\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Patrick\\\", \\\"family\\\": \\\"Martone\\\"}, {\\\"given\\\": \\\"Iria\\\", \\\"family\\\": \\\"Gimenez\\\"}], \\\"issued\\\": [{\\\"date-parts\\\": [\\\"2025\\\", \\\"05\\\", \\\"08\\\"]}], \\\"abstract\\\": \\\"Ce paquet de donn\\u00e9es fait partie du projet collaboratif Marna Wet Lab de l'Institut Hakai et du Martone Lab (Universit\\u00e9 de la Colombie-Britannique, UBC) qui \\u00e9tudie les effets environnementaux sur les algues coralliennes. Le programme de recherche exp\\u00e9rimentale Marna Wet Lab de l'Institut Hakai utilise des exp\\u00e9riences de laboratoire pour \\u00e9valuer les r\\u00e9ponses des organismes marins \\u00e0 des conditions environnementales oc\\u00e9aniques simul\\u00e9es actuelles et futures. L'objectif principal de la recherche exp\\u00e9rimentale du Hakai Wet Lab est d'\\u00e9tudier les m\\u00e9canismes de vuln\\u00e9rabilit\\u00e9 et de r\\u00e9silience de diverses esp\\u00e8ces et communaut\\u00e9s marines dans des conditions environnementales futures statiques ou dynamiques, et de comprendre comment les organismes r\\u00e9agissent ph\\u00e9notypiquement, physiologiquement et/ou g\\u00e9nomiquement au stress thermique et \\u00e0 l'acidification.\\n\\nLes algues corallines constituent un groupe diversifi\\u00e9 d'algues rouges calcifiantes qui peuplent un large \\u00e9ventail d'environnements marins dans le monde entier o\\u00f9 elles fournissent un soutien structurel aux r\\u00e9cifs, cr\\u00e9ent un habitat et des ressources alimentaires pour les invert\\u00e9br\\u00e9s et soutiennent la biodiversit\\u00e9 en favorisant le recrutement de larves et de varech. L'une des caract\\u00e9ristiques uniques de ce groupe d'algues rouges est qu'elles d\\u00e9posent du carbonate de calcium dans leurs parois cellulaires v\\u00e9g\\u00e9tatives, cr\\u00e9ant ainsi une structure de thalle rigide essentielle au soutien et \\u00e0 l'habitat. Bien que la calcification soit un processus cl\\u00e9 pour la physiologie et l'\\u00e9cologie des algues coralliennes, on en sait peu sur les m\\u00e9canismes mol\\u00e9culaires, physiologiques et cellulaires qui la soutiennent et sur la mani\\u00e8re dont ceux-ci peuvent \\u00eatre affect\\u00e9s par les changements climatiques. Des travaux sur d'autres esp\\u00e8ces tropicales d'algues coralliennes ont toutefois sugg\\u00e9r\\u00e9 que les algues calcifiantes pourraient \\u00eatre particuli\\u00e8rement sensibles au stress thermique et \\u00e0 l'acidification, bien que les r\\u00e9ponses des esp\\u00e8ces temp\\u00e9r\\u00e9es soient largement sous-\\u00e9tudi\\u00e9es.\\n\\nDes travaux sont en cours dans le laboratoire du Dr Patrick Martone pour identifier des g\\u00e8nes de calcification putatifs \\u00e0 l'aide de transcriptomes sp\\u00e9cifiques aux tissus (calcifi\\u00e9s ou non calcifi\\u00e9s) (RNASeq) chez l'algue coralline articul\\u00e9e, Calliarthron tuberculosis. L'objectif de ce travail est de comprendre les fondements mol\\u00e9culaires du m\\u00e9canisme de calcification en mettant en \\u00e9vidence les principaux g\\u00e8nes de calcification et en d\\u00e9veloppant des amorces qPCR sp\\u00e9cifiques aux g\\u00e8nes pour \\u00e9tudier l'expression des g\\u00e8nes. Sur la base de ces travaux fondamentaux, nous proposons d'explorer les effets interactifs du pH et de la temp\\u00e9rature sur une population de Calvert de Calliarthron en nous concentrant sur la calcification, l'expression g\\u00e9nique, la croissance et les r\\u00e9ponses physiologiques au stress par le biais d'une exp\\u00e9rience en m\\u00e9socosme de plusieurs semaines.\\n\\nCe paquet de donn\\u00e9es comprend une partie des donn\\u00e9es de cette exp\\u00e9rience concernant la temp\\u00e9rature du m\\u00e9socosme et la chimie des carbonates et les protocoles associ\\u00e9s, le traitement et l'analyse de ces donn\\u00e9es collect\\u00e9es par l'\\u00e9quipe du Marna Wet Lab. Des donn\\u00e9es exp\\u00e9rimentales suppl\\u00e9mentaires sont d\\u00e9tenues par nos collaborateurs Emma Jourdain et Patrick Martone (UBC).\\n\\nCompte tenu des efforts n\\u00e9cessaires pour obtenir ces donn\\u00e9es et cr\\u00e9er des packages de donn\\u00e9es, nous demandons \\u00e0 tous les utilisateurs de donn\\u00e9es de respecter les termes de la licence CC-BY, de citer les fournisseurs de donn\\u00e9es et de suivre les directives d'utilisation \\u00e9quitable\\u00a0: 1) respecter les fournisseurs de donn\\u00e9es et fournir des commentaires utiles sur la qualit\\u00e9 des donn\\u00e9es, et 2) communiquer et/ou collaborer avec les chercheurs et collaborateurs du Hakai Marna Wet Lab si vous envisagez d'utiliser cet ensemble de donn\\u00e9es pour des manuscrits ou d'autres formes de reporting.\\\", \\\"edition-date\\\": \\\"\\\", \\\"publisher\\\": \\\"Hakai Institute\\\", \\\"title\\\": \\\"Exp\\u00e9rience Calliarthron 2023 - Donn\\u00e9es environnementales\\\", \\\"version\\\": \\\"1.0.0\\\", \\\"DOI\\\": \\\"10.21966/7nwn-bj60\\\", \\\"language\\\": \\\"fr\\\", \\\"URL\\\": \\\"https://catalogue.hakai.org/dataset/ca-cioos_78818ed7-ec26-4004-afa1-137741ddda1e?local=fr\\\"}]"},"keywords":{"en":["oceans","pco2","water-temperature","calliarthron-tuberculosum","carbonate-chemistry","mesocosms","coralline-algae","ph","ocean-acidification","other","inorganiccarbon","rhodophyta","corallinaceae","calliarthron","corallinales","plantae","florideophyceae","wet-lab"],"fr":["temperature-de-leau","autre","carbone-inorganique","rhodophyta","corallinaceae","calliarthron","calliarthron-tuberculosum","corallinales","plantae","florideophyceae"]},"num_tags":0,"progress":"completed","projects":["Wet Lab"],"owner_org":"f6f187f7-19f2-4273-a45a-5d9406204873","resources":[{"id":"145d5a8a-7b2b-4d6c-85ef-94b4773bc4ed","url":"https://github.com/HakaiInstitute/hakai-wetlab-calliarthron2023","hash":"","name":"Expérience Calliarthron 2023 - Données environnementales - v1.0.0","size":null,"state":"active","format":"HTML","created":"2025-11-08T00:18:22.291789","mimetype":null,"position":0,"url_type":null,"cache_url":null,"package_id":"e4038a43-060b-474e-b6f2-ea68d0081053","description":"Ce package de données collecte des données et des informations relatives aux protocoles, à la collecte de données, au traitement et à l'analyse des données collectées par l'équipe du Hakai Marna Wet Lab lors de l'expérience Calliarthron 2023. Ce dépôt est actuellement privé, veuillez contacter les auteurs pour plus d'informations.","last_modified":null,"resource_type":null,"created_source":"2025-11-08T00:18:22.291789","mimetype_inner":null,"name_translated":{"en":"Calliarthron 2023 Experiment - Environmental Data - v1.0.0","fr":"Expérience Calliarthron 2023 - Données environnementales - v1.0.0"},"datastore_active":false,"metadata_modified":"2026-09-16T20:40:02.877501","cache_last_updated":null,"description_translated":{"en":"This data package collects data and information relating to protocols, data collection, processing and analysis of data collected by the Hakai Marna Wet Lab team during the Calliarthron 2023 experiment. This repository is currently private, please contact the authors for more information.","fr":"Ce package de données collecte des données et des informations relatives aux protocoles, à la collecte de données, au traitement et à l'analyse des données collectées par l'équipe du Hakai Marna Wet Lab lors de l'expérience Calliarthron 2023. Ce dépôt est actuellement privé, veuillez contacter les auteurs pour plus d'informations."},"metadata_modified_source":"2025-11-08T00:18:22.210873","resource_locator_function":"","resource_locator_protocol":"WWW:LINK"}],"datacentre":[],"license_id":"CC-BY-4.0","maintainer":null,"distributor":[{"role":["distributor"],"individual-name":"Martone, Patrick","organisation-name":"University of British Columbia","contact-info_email":"","individual-uri_code":"https://orcid.org/0000-0002-6345-1023","organisation-uri_code":"https://ror.org/03rmrcq20","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":["distributor"],"individual-name":"Gimenez, Iria","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"iria.gimenez@hakai.org","individual-uri_code":"https://orcid.org/0000-0001-5916-4446","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""}],"license_url":"https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/","author_email":null,"organization":{"id":"f6f187f7-19f2-4273-a45a-5d9406204873","name":"cioos-pacific","type":"organization","state":"active","title":"SIOOC-Pacifique","created":"2026-07-31T15:58:21.015456","image_url":"","description":"","display_name":"CIOOS-Pacific","num_followers":0,"approval_status":"approved","is_organization":true,"organization-uri":[{"code":"","version":"","authority":"","code-space":""}],"title_translated":{"en":"CIOOS-Pacific","fr":"SIOOC-Pacifique"},"external_home_url":"https://cioospacific.ca","image_display_url":"","image_url_translated":{"en":"https://catalogue.cioos.ca/base/images/logos/cioos-pacific_logo_RA_EN.png","fr":"https://catalogue.cioos.ca/base/images/logos/cioos-pacific_logo_RA_FR.png"},"description_translated":{"en":"The Canadian Integrated Ocean Observing System (CIOOS) Pacific is the regional hub of the National CIOOS for ocean data aggregation on Canada’s west coast.","fr":"Le Système intégré d’observation des océans canadien (SIOOC) Pacifique est la plaque tournante régionale du SIOOC national pour l’agrégation des données océaniques sur la côte ouest du Canada."}},"license_title":"Creative Commons Attribution 4.0","num_resources":1,"resource-type":"dataset","bbox-east-long":"-125.2","bbox-north-lat":"50.12","bbox-south-lat":"50.12","bbox-west-long":"-125.2","creator_user_id":"fe6035ee-ed91-4ead-b5b2-4048232a22bb","temporal-extent":[{"end":"2023-11-28","begin":"2023-10-18"}],"vertical-extent":[{"max":"0","min":"0"}],"maintainer_email":null,"maintenance-note":"Generated from https://hakaiinstitute.github.io/hakai-metadata-entry-form#/en/hakai/KstJ1LGR2ZbovZiE2SeSKVz4y4E2/-O6XAwxhj0r9Xs-V2QSA","metadata_created":"2026-07-31T16:31:27.217403","notes_translated":{"en":"This data package is a component of the Hakai Institute’s Marna Wet Lab and the Martone Lab (University of British Columbia, UBC) collaborative project investigating environmental effects on coralline algae. Hakai Institute's Marna Wet Lab experimental research program uses laboratory experiments to evaluate marine organisms' responses to simulated current and future ocean environmental conditions. The overarching objective of Hakai Wet Lab experimental research is to investigate the mechanisms of vulnerability and resilience of a variety of marine species and communities under static or dynamic future environmental conditions, and understand how organisms are responding phenotypically, physiologically and/or genomically to thermal and acidification stress.\n\nCoralline algae are a diverse group of calcifying red algae that populate a wide range of marine environments globally where they provide structural support to reefs, create habitat and food resources for invertebrates and support biodiversity by promoting larval and kelp recruitment. A unique characteristic of this group of red algae is that they deposit calcium carbonate within their vegetative cell walls creating a hard thallus structure that is essential for providing support and habitat. While calcification is a key process for coralline algae physiology and ecology there is little known about the molecular, physiological and cellular mechanisms that support it and how those might be affected by changing climate conditions. Work on other tropical species of coralline algae, however, has suggested that calcifying algae might be particularly sensitive to thermal and acidification stress, though responses of temperate species are vastly understudied.\n\nCurrent work in Dr. Patrick Martone's lab is underway to identify putative calcification genes using tissue-specific (calcified vs. uncalcified) transcriptomes (RNAseq) in the articulated coralline alga, Calliarthron tuberculosum. The aim of this work is to understand the molecular underpinnings of the calcification mechanism by highlighting key calcification genes and developing gene-specific qPCR primers to study gene expression. Building on this foundational work, we propose to explore the interactive effects of pH and temperature on a Calvert population of Calliarthron focusing on calcification, gene expression, growth, and physiological stress responses through a multi-week mesocosm experiment.\n\nThis data package includes a portion of the data from this experiment relating to mesocosm temperature and carbonate chemistry and associated protocols, processing and analysis of that data collected by the Marna Wet Lab team. Additional experimental data is held by our collaborators Emma Jourdain and Patrick Martone (UBC). All data will be available upon request until the manuscript has been accepted at which time the data will be made publicly available. \n\nIn light of the effort required to obtain these data and create data packages, we request all data users that, in addition to following the CC-BY license terms, they give attribution to the data providers and follow fair use guidelines: 1) respect the data providers, and provide helpful feedback on data quality, and 2) communicate and/or collaborate with Hakai Marna Wet Lab researchers and collaborators if you are considering using this dataset for manuscripts or other forms of reporting.","fr":"Ce paquet de données fait partie du projet collaboratif Marna Wet Lab de l'Institut Hakai et du Martone Lab (Université de la Colombie-Britannique, UBC) qui étudie les effets environnementaux sur les algues coralliennes. Le programme de recherche expérimentale Marna Wet Lab de l'Institut Hakai utilise des expériences de laboratoire pour évaluer les réponses des organismes marins à des conditions environnementales océaniques simulées actuelles et futures. L'objectif principal de la recherche expérimentale du Hakai Wet Lab est d'étudier les mécanismes de vulnérabilité et de résilience de diverses espèces et communautés marines dans des conditions environnementales futures statiques ou dynamiques, et de comprendre comment les organismes réagissent phénotypiquement, physiologiquement et/ou génomiquement au stress thermique et à l'acidification.\n\nLes algues corallines constituent un groupe diversifié d'algues rouges calcifiantes qui peuplent un large éventail d'environnements marins dans le monde entier où elles fournissent un soutien structurel aux récifs, créent un habitat et des ressources alimentaires pour les invertébrés et soutiennent la biodiversité en favorisant le recrutement de larves et de varech. L'une des caractéristiques uniques de ce groupe d'algues rouges est qu'elles déposent du carbonate de calcium dans leurs parois cellulaires végétatives, créant ainsi une structure de thalle rigide essentielle au soutien et à l'habitat. Bien que la calcification soit un processus clé pour la physiologie et l'écologie des algues coralliennes, on en sait peu sur les mécanismes moléculaires, physiologiques et cellulaires qui la soutiennent et sur la manière dont ceux-ci peuvent être affectés par les changements climatiques. Des travaux sur d'autres espèces tropicales d'algues coralliennes ont toutefois suggéré que les algues calcifiantes pourraient être particulièrement sensibles au stress thermique et à l'acidification, bien que les réponses des espèces tempérées soient largement sous-étudiées.\n\nDes travaux sont en cours dans le laboratoire du Dr Patrick Martone pour identifier des gènes de calcification putatifs à l'aide de transcriptomes spécifiques aux tissus (calcifiés ou non calcifiés) (RNASeq) chez l'algue coralline articulée, Calliarthron tuberculosis. L'objectif de ce travail est de comprendre les fondements moléculaires du mécanisme de calcification en mettant en évidence les principaux gènes de calcification et en développant des amorces qPCR spécifiques aux gènes pour étudier l'expression des gènes. Sur la base de ces travaux fondamentaux, nous proposons d'explorer les effets interactifs du pH et de la température sur une population de Calvert de Calliarthron en nous concentrant sur la calcification, l'expression génique, la croissance et les réponses physiologiques au stress par le biais d'une expérience en mésocosme de plusieurs semaines.\n\nCe paquet de données comprend une partie des données de cette expérience concernant la température du mésocosme et la chimie des carbonates et les protocoles associés, le traitement et l'analyse de ces données collectées par l'équipe du Marna Wet Lab. Des données expérimentales supplémentaires sont détenues par nos collaborateurs Emma Jourdain et Patrick Martone (UBC).\n\nCompte tenu des efforts nécessaires pour obtenir ces données et créer des packages de données, nous demandons à tous les utilisateurs de données de respecter les termes de la licence CC-BY, de citer les fournisseurs de données et de suivre les directives d'utilisation équitable : 1) respecter les fournisseurs de données et fournir des commentaires utiles sur la qualité des données, et 2) communiquer et/ou collaborer avec les chercheurs et collaborateurs du Hakai Marna Wet Lab si vous envisagez d'utiliser cet ensemble de données pour des manuscrits ou d'autres formes de reporting."},"title_translated":{"en":"Calliarthron 2023 Experiment - Environmental Data","fr":"Expérience Calliarthron 2023 - Données environnementales"},"xml_location_url":"https://metadata-generator-proxy.server.hakai.app/metadata/hakai/calliarthron_2023_experiment___78818.xml","metadata-language":"en","metadata_modified":"2026-09-16T20:40:02.871658","frequency-of-update":"asNeeded","dataset-reference-date":[{"type":"creation","value":"2023-10-18"},{"type":"publication","value":"2025-05-08"}],"cited-responsible-party":[{"role":["author","custodian","pointOfContact","editor"],"individual-name":"Rolheiser, Kate","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"kate.rolheiser@hakai.org","individual-uri_code":"https://orcid.org/0000-0001-9057-1533","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":["custodian","coAuthor","editor"],"individual-name":"Collicutt, Brenna","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"brenna.collicutt@hakai.org","individual-uri_code":"https://orcid.org/0000-0002-6821-940X","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":["author","custodian","pointOfContact"],"individual-name":"Jourdain, Emma","organisation-name":"University of British Columbia","contact-info_email":"emjourdain719@gmail.com","individual-uri_code":"https://orcid.org/0009-0002-4350-2177","organisation-uri_code":"https://ror.org/03rmrcq20","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":["coAuthor","editor"],"individual-name":"Etzkorn, Jacob M","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"jacob.etzkorn@hakai.org","individual-uri_code":"https://orcid.org/0009-0003-2162-690X","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":"contributor","individual-name":"McCay, Shelby","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"","individual-uri_code":"https://orcid.org/0009-0000-7483-4524","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":"contributor","individual-name":"Vinson, Bradford","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"brad.vinson@hakai.org","individual-uri_code":"https://orcid.org/0009-0008-0315-9419","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":["author","custodian","distributor","owner","principalInvestigator"],"individual-name":"Martone, Patrick","organisation-name":"University of British Columbia","contact-info_email":"","individual-uri_code":"https://orcid.org/0000-0002-6345-1023","organisation-uri_code":"https://ror.org/03rmrcq20","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":["author","distributor","owner","principalInvestigator","editor"],"individual-name":"Gimenez, Iria","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"iria.gimenez@hakai.org","individual-uri_code":"https://orcid.org/0000-0001-5916-4446","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":"publisher","individual-name":"","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","organisation-uri_version":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":""}],"metadata-reference-date":[{"type":"publication","value":"2025-05-08"},{"type":"revision","value":"2025-05-08"}],"relationships_as_object":[],"notes_translation_method":{"en":"","fr":"text translated using the Amazon translate service / texte traduit à l'aide du service de traduction Amazon"},"relationships_as_subject":[],"title_translation_method":{"en":"","fr":"text translated using the Amazon translate service / texte traduit à l'aide du service de traduction Amazon"},"metadata-point-of-contact":[{"role":["author","custodian","pointOfContact","editor"],"individual-name":"Rolheiser, Kate","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"kate.rolheiser@hakai.org","individual-uri_code":"https://orcid.org/0000-0001-9057-1533","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":["custodian","coAuthor","editor"],"individual-name":"Collicutt, Brenna","organisation-name":"Hakai Institute","contact-info_email":"brenna.collicutt@hakai.org","individual-uri_code":"https://orcid.org/0000-0002-6821-940X","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":["author","custodian","pointOfContact"],"individual-name":"Jourdain, Emma","organisation-name":"University of British Columbia","contact-info_email":"emjourdain719@gmail.com","individual-uri_code":"https://orcid.org/0009-0002-4350-2177","organisation-uri_code":"https://ror.org/03rmrcq20","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":["author","custodian","distributor","owner","principalInvestigator"],"individual-name":"Martone, Patrick","organisation-name":"University of British Columbia","contact-info_email":"","individual-uri_code":"https://orcid.org/0000-0002-6345-1023","organisation-uri_code":"https://ror.org/03rmrcq20","individual-uri_version":"","individual-uri_authority":"","organisation-uri_version":"","individual-uri_code-space":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":"","contact-info_online-resource":""},{"role":"funder","individual-name":"","organisation-name":"Tula Foundation","contact-info_email":"","individual-uri_code":"","organisation-uri_code":"https://ror.org/02pry0c91","organisation-uri_version":"","organisation-uri_authority":"","organisation-uri_code-space":""}],"included_in_data_catalogue":[{"url":"https://catalogue.cioos.ca","name":{"en":"CIOOS Catalogue","fr":"Catalogue du SIOOC"},"description":""},{"url":"https://catalogue.hakai.org","name":{"en":"Hakai Data Catalogue","fr":"Hakai Data Catalogue"},"description":{"en":"Science on the Coastal Margin","fr":"Science on the Coastal Margin"}},{"url":"https://temp_cat.cioospacific.ca","name":{"en":"CIOOS Pacific","fr":"SIOOC Pacifique"},"description":{"en":"A description of the Catalogue","fr":"Une description du catalogue"}}],"keywords_translation_method":{"en":""},"unique-resource-identifier-full":[{"code":"https://doi.org/10.21966/7nwn-bj60","version":"","authority":"","code-space":""}]}}